MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Metallosphaera cuprina Ar-4 chromosome

Total Repeats: 30316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015435	CGA	2	6	15	20	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833868
2	NC_015435	TCA	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833868
3	NC_015435	AG	3	6	61	66	50 %	0 %	50 %	0 %	330833868
4	NC_015435	CCT	2	6	69	74	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833868
5	NC_015435	AG	3	6	106	111	50 %	0 %	50 %	0 %	330833868
6	NC_015435	AAG	2	6	244	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
7	NC_015435	AAC	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833868
8	NC_015435	GTTA	2	8	384	391	25 %	50 %	25 %	0 %	330833868
9	NC_015435	AGA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
10	NC_015435	TGA	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
11	NC_015435	ATT	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833868
12	NC_015435	TAAC	2	8	536	543	50 %	25 %	0 %	25 %	330833868
13	NC_015435	AAG	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
14	NC_015435	GAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
15	NC_015435	TCC	2	6	612	617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833868
16	NC_015435	AAG	2	6	648	653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
17	NC_015435	TCC	2	6	658	663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833868
18	NC_015435	AAGG	2	8	673	680	50 %	0 %	50 %	0 %	330833868
19	NC_015435	GCT	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833868
20	NC_015435	GCT	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330833868
21	NC_015435	CTT	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833868
22	NC_015435	AGA	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
23	NC_015435	GA	3	6	826	831	50 %	0 %	50 %	0 %	330833868
24	NC_015435	TAGAAA	2	12	839	850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	330833868
25	NC_015435	AGA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833868
26	NC_015435	AT	3	6	958	963	50 %	50 %	0 %	0 %	330833868
27	NC_015435	ACTT	2	8	978	985	25 %	50 %	0 %	25 %	330833868
28	NC_015435	ATG	2	6	1048	1053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
29	NC_015435	TGA	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
30	NC_015435	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833868
31	NC_015435	CT	4	8	1203	1210	0 %	50 %	0 %	50 %	330833869
32	NC_015435	TTA	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833869
33	NC_015435	AGG	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833869
34	NC_015435	TA	3	6	1388	1393	50 %	50 %	0 %	0 %	330833869
35	NC_015435	TA	3	6	1409	1414	50 %	50 %	0 %	0 %	330833869
36	NC_015435	GAAGA	2	10	1487	1496	60 %	0 %	40 %	0 %	330833869
37	NC_015435	AG	3	6	1528	1533	50 %	0 %	50 %	0 %	330833869
38	NC_015435	TCC	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833870
39	NC_015435	ATA	2	6	1739	1744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833870
40	NC_015435	AGTGA	2	10	1855	1864	40 %	20 %	40 %	0 %	330833870
41	NC_015435	AG	3	6	1895	1900	50 %	0 %	50 %	0 %	330833870
42	NC_015435	CTA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833870
43	NC_015435	CAT	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833870
44	NC_015435	AT	3	6	2101	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	330833870
45	NC_015435	CCT	2	6	2197	2202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833870
46	NC_015435	CT	3	6	2316	2321	0 %	50 %	0 %	50 %	330833870
47	NC_015435	CCG	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330833870
48	NC_015435	TC	3	6	2624	2629	0 %	50 %	0 %	50 %	330833871
49	NC_015435	TAAT	2	8	2713	2720	50 %	50 %	0 %	0 %	330833871
50	NC_015435	TC	3	6	2734	2739	0 %	50 %	0 %	50 %	330833871
51	NC_015435	ATG	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833871
52	NC_015435	GTAC	2	8	2833	2840	25 %	25 %	25 %	25 %	330833871
53	NC_015435	AT	3	6	2875	2880	50 %	50 %	0 %	0 %	330833871
54	NC_015435	TCA	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833871
55	NC_015435	ATC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833871
56	NC_015435	CGG	2	6	2962	2967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330833871
57	NC_015435	CAT	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833872
58	NC_015435	CTT	2	6	3123	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833872
59	NC_015435	AGT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833872
60	NC_015435	ACCT	2	8	3262	3269	25 %	25 %	0 %	50 %	330833872
61	NC_015435	TAAAGC	2	12	3310	3321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330833872
62	NC_015435	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833872
63	NC_015435	ATA	2	6	3456	3461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833872
64	NC_015435	GATA	2	8	3518	3525	50 %	25 %	25 %	0 %	330833872
65	NC_015435	ATCA	2	8	3538	3545	50 %	25 %	0 %	25 %	330833872
66	NC_015435	TCA	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833872
67	NC_015435	TTGA	2	8	3572	3579	25 %	50 %	25 %	0 %	330833872
68	NC_015435	TC	3	6	3646	3651	0 %	50 %	0 %	50 %	330833872
69	NC_015435	GATC	2	8	3666	3673	25 %	25 %	25 %	25 %	330833872
70	NC_015435	ACT	2	6	3674	3679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833872
71	NC_015435	T	6	6	3692	3697	0 %	100 %	0 %	0 %	330833872
72	NC_015435	ACA	2	6	3720	3725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833872
73	NC_015435	CTT	2	6	3799	3804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833872
74	NC_015435	TTC	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833873
75	NC_015435	TTG	2	6	4131	4136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330833873
76	NC_015435	CT	3	6	4157	4162	0 %	50 %	0 %	50 %	330833873
77	NC_015435	TCC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833873
78	NC_015435	CTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833873
79	NC_015435	A	6	6	4426	4431	100 %	0 %	0 %	0 %	330833874
80	NC_015435	CTT	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833874
81	NC_015435	T	6	6	4498	4503	0 %	100 %	0 %	0 %	330833874
82	NC_015435	AT	3	6	4507	4512	50 %	50 %	0 %	0 %	330833874
83	NC_015435	AT	3	6	4522	4527	50 %	50 %	0 %	0 %	330833874
84	NC_015435	AGA	2	6	4549	4554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833874
85	NC_015435	CCTTT	2	10	4572	4581	0 %	60 %	0 %	40 %	330833874
86	NC_015435	CAA	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330833874
87	NC_015435	AT	3	6	4741	4746	50 %	50 %	0 %	0 %	330833874
88	NC_015435	AGG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833874
89	NC_015435	CAT	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833874
90	NC_015435	AGG	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833874
91	NC_015435	TGA	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833874
92	NC_015435	AAT	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833874
93	NC_015435	AG	3	6	4906	4911	50 %	0 %	50 %	0 %	330833874
94	NC_015435	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833874
95	NC_015435	G	6	6	4989	4994	0 %	0 %	100 %	0 %	330833874
96	NC_015435	ACTT	2	8	5014	5021	25 %	50 %	0 %	25 %	330833874
97	NC_015435	TGA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833874
98	NC_015435	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833874
99	NC_015435	A	6	6	5167	5172	100 %	0 %	0 %	0 %	330833874
100	NC_015435	GAT	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833874
101	NC_015435	GA	3	6	5291	5296	50 %	0 %	50 %	0 %	330833874
102	NC_015435	GTTT	2	8	5390	5397	0 %	75 %	25 %	0 %	330833874
103	NC_015435	GAA	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833875
104	NC_015435	CT	3	6	5451	5456	0 %	50 %	0 %	50 %	330833875
105	NC_015435	AT	3	6	5518	5523	50 %	50 %	0 %	0 %	330833875
106	NC_015435	CAAA	2	8	5672	5679	75 %	0 %	0 %	25 %	330833875
107	NC_015435	GTA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833875
108	NC_015435	GA	3	6	5740	5745	50 %	0 %	50 %	0 %	330833875
109	NC_015435	ATT	2	6	5763	5768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330833875
110	NC_015435	AAG	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833875
111	NC_015435	GAT	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833875
112	NC_015435	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833875
113	NC_015435	AG	3	6	5866	5871	50 %	0 %	50 %	0 %	330833875
114	NC_015435	GGA	2	6	5872	5877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833875
115	NC_015435	TAAAG	2	10	5878	5887	60 %	20 %	20 %	0 %	330833875
116	NC_015435	GAAGA	2	10	5960	5969	60 %	0 %	40 %	0 %	330833876
117	NC_015435	GGCA	2	8	6094	6101	25 %	0 %	50 %	25 %	330833876
118	NC_015435	AAT	2	6	6124	6129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833876
119	NC_015435	AGG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833876
120	NC_015435	AG	3	6	6187	6192	50 %	0 %	50 %	0 %	330833876
121	NC_015435	TCA	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833876
122	NC_015435	CTTC	2	8	6341	6348	0 %	50 %	0 %	50 %	330833876
123	NC_015435	GGT	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833876
124	NC_015435	CAGAA	2	10	6403	6412	60 %	0 %	20 %	20 %	330833876
125	NC_015435	ATC	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833876
126	NC_015435	ATA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833876
127	NC_015435	TAG	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833876
128	NC_015435	TGG	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330833876
129	NC_015435	AG	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	330833876
130	NC_015435	GCA	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330833876
131	NC_015435	TCA	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833876
132	NC_015435	CCAGA	2	10	6720	6729	40 %	0 %	20 %	40 %	330833876
133	NC_015435	CTC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833876
134	NC_015435	GAG	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330833876
135	NC_015435	TCTGT	2	10	7027	7036	0 %	60 %	20 %	20 %	330833877
136	NC_015435	TAG	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330833877
137	NC_015435	AT	4	8	7242	7249	50 %	50 %	0 %	0 %	330833877
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269	NC_015435	CTAG	2	8	15311	15318	25 %	25 %	25 %	25 %	330833884
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396	NC_015435	CCT	2	6	22650	22655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833891
397	NC_015435	CATTCC	2	12	22693	22704	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330833891
398	NC_015435	AGA	2	6	22721	22726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330833891
399	NC_015435	TCC	2	6	22778	22783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330833891
400	NC_015435	CTT	2	6	22796	22801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330833891
401	NC_015435	CAT	2	6	22866	22871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330833891
402	NC_015435	GA	3	6	22875	22880	50 %	0 %	50 %	0 %	330833891
403	NC_015435	AAT	2	6	22911	22916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330833891
404	NC_015435	CCTT	2	8	22980	22987	0 %	50 %	0 %	50 %	330833891
405	NC_015435	TA	3	6	23068	23073	50 %	50 %	0 %	0 %	330833891
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409	NC_015435	TGCA	2	8	23287	23294	25 %	25 %	25 %	25 %	330833892
410	NC_015435	CT	3	6	23386	23391	0 %	50 %	0 %	50 %	330833892
411	NC_015435	AG	3	6	23402	23407	50 %	0 %	50 %	0 %	330833892
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486	NC_015435	AGCT	2	8	26370	26377	25 %	25 %	25 %	25 %	330833897
487	NC_015435	TA	3	6	26390	26395	50 %	50 %	0 %	0 %	330833897
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